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生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體(如禽畜糞便、農作物秸稈等)為來源并經無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。
生物有機肥區別于一般的有機肥,主要是添加了菌種,政策規定的菌種要求:使用的微生物菌種應安全、有效,有明確來源和種名。菌株安全性應符合【NY/T 1109-2017】的規定。外觀:粉劑產品應松散、無惡臭味;顆粒產品應無明顯機械雜質、大小均勻、無腐敗味。
生物有機肥執行中華人民共和國農業行業標準[《生物有機肥》(NY 884-2012)]:

生物有機肥的技術指標
生物有機肥實際上是有機肥料的再加工,是特定功能微生物與有機肥料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。
生物有機肥除具有有機肥料的作用外,還具有生物肥的作用。例如:具有增進土壤肥力,活化土壤中難溶的化合物供作物吸收作用,或可產生活性物質和抗、抑病物質,對農作物的生長有良好的刺激與調控作用,可減少或降低作物病蟲害的發生。
